외교부는 6일 오전 기자들에게 보낸 문자 메시지에서 일본 정부의 조치를 '입국거부'로 규정한 뒤 "정부가 그동안 일측에 추가 조치에 대한 신중한 검토를 수차례 촉구했음에도 불구하고 사전에 우리와 충분한 협의도 없이 이러한 불합리하고 과도한 조치를 취한 데 대해 극히 유감을 표한다"며 "금번 조치를 즉각 재고할 것을 강력히 촉구한다"고 밝혔다.
이어 "정부가 코로나19 확산 방지를 위해 범정부차원에서 총력을 기울이고 있는 가운데 우리의 우수한 검사·진단 능력과 투명하고 적극적인 방역 노력을 전 세계가 평가하고 있고 확산방지 노력의 성과가 보이는 시점에서 취해진 조치라는 점에서 방역 외 다른 의도가 있는 것은 아닌지 의심할 수밖에 없다"고 언급했다.
외교부는 '일본에 대한 오염지역 지정·여행경보 격상 등 상응조치 여부'와 관련해서는 "우리 국민들의 보건과 안전을 최우선으로 고려하면서 모든 가능한 조치들을 검토 중에 있다"고 강조했다.
일본이 이날 발표한 '2주간 대기'는 사실상의 입국금지로 평가된다. 2주간의 격리 후에야 일본 입국이 가능해질 경우 이를 감수하고 일본에 가는 경우가 극히 드물 것으로 보여서다. 아울러 한국과 중국에서 일본으로 오는 항공편의 경우 나리타 공항과 오사카 간사이 공항으로 제한한다고 밝혔다.