9일 윤 후보는 중앙일보와 가진 단독 인터뷰에서 "집권하면 전 정권 적폐청산 수사를 할 것이냐"라는 질문에 이같이 답했다. 윤 후보는 "(적폐청산) 해야죠. (수사가) 돼야죠"라면서도 "대통령은 수사에 관여하지 않을 것"이라고 말했다.
윤 후보는 지난 2017년 문재인정부 출범 직후 대전고등검찰청 검사에서 서울중앙지검장으로 승진했다. 윤 후보는 지검장 시절 이명박·박근혜 보수 정권의 불법에 대한 수사를 지휘했다.
윤 후보는 집권 시 최측근 검찰 간부를 검찰 요직에 임명해 검찰공화국을 만들 것이란 우려엔 "그건 여권의 프레임"이라며 부인했다. 윤 후보는 "민주당 정권이 검찰을 이용해서 얼마나 많은 범죄를 저질렀나"라며 "거기에 상응한 책임을 져야 한다"고 주장했다.
다만 윤 후보는 "(A 검사장은) 굉장히 유능한 검사이기 때문에 아마 검찰 인사가 정상화되면 각자 다 중요한 자리에 갈 거라고 판단된다"며 "워낙 경쟁력 있는 사람"이라고 덧붙였다.